CLC Genomics Workbench

產品詳情


CLC Genomics Workbench

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? CLC Genomics Workbench是一個綜合性高通量數據分析包,支持Sanger、454、Illumina 、SOLiD和 Ion Torrent等主流測序儀產生的測序數據。該軟件專為生物學家設計制作,直觀的界面、操作簡便及用戶友好的分析功能極大地簡化了二代測序數據分析。CLC Genomics Workbench靈活性高,兼容用戶開發的算法,擴展該軟件的工作流程。

? CLC Genomics Workbench支持Mac OS X、Windows、和Linux操作系統。


主要應用領域
????? CLC Genomics Workbench適用于遺傳學、轉錄組學、表觀遺傳學和宏基因組學研究。

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CLC Genomics Workbench功能
????? 對來自上述測序平臺產出的原始數據的質量控制,包括原始數據的質量評估和data trimming以及PCR duplication的去除。多樣本數據的自動分離。基因組數據的從頭組裝、重測序數據的mapping、SNP/InDel/CNV/SV突變檢出和注釋、比較基因組數據的分析以及結果的圖形化展示。RNA-seq數據的差異表達分析和統計測驗以及結果作圖。miRNA數據的mapping、聚類和二級結構預測及功能注釋。標簽表達譜數據的分析。表觀遺傳學ChIP-seq數據的分析。


基因組學
1.讀取Sanger、454、 Illumina 、 SOLiD和 Ion Torrent的測序數據,對原始數據質量評估、data trimming及去除PCR duplication
2.De novo 拼接、重測序數據的mapping、檢測和注釋SNP/InDel/CNV/SV突變、比較基因組數據的分析及結果的圖形化展示
3.支持多種類型的混合數據分析
4.Color space mapping
5.高級視圖與縮放工具
6.序列分析工具(檢測突變和下游序列分析)
7.支持多重檢測DNA 序列標簽


轉錄組學
????? RNA-seq incl. 支持雙端測序數據和轉錄水平表達
????? 小RNA分析
????? 表達譜標簽
????? 創建表達序列標簽庫
????? 高級視圖與縮放工具
????? 基因表達分析


表觀基因組學
????? ChIP-seq分析
????? 峰值檢測和優化
????? 對照組與實驗組分析


經典序列分析工具
????? 引物設計
????? 分子克隆
????? BLAST
????? 進化樹構建
????? RNA高級結構分析和編輯
???? 限制性酶切位點分析
????? 蛋白質二級結構預測
????? 其他功能


CLC Genomics Workbench的主要優勢:
????? 圖形化用戶界面,安裝和操作簡單,類似Office軟件的使用,無需命令行和編程技能,結果可以直觀查看,并支持多種格式的輸出,圖表結果可以直接用來發表文章。

????? 支持包括Mac、Windows和Linux在內的多種操作系統平臺,支持目前主流的所有測序平臺數據和來自第三方軟件的中間結果數據的導入分析和混合平臺數據的分析。

????? 整合和開發的專有算法,較其他軟件在分析速度和質量上都有明顯優勢。

????? 軟件自身整合了所有必要的功能,避免了其他軟件在繁瑣的上下游數據的格式間轉換。Workflow功能更能輕松自定義工作流程,Batch批量分析,快速高效分析海量測序數據。

????? 除了計算能力,CLC Genomics Workbench提供了靈活的工作系統,輕松整合其他應用程序和共享數據以及一系列的其他功能,確保你的高通量序列分析在快速、安全、和靈活的IT環境下運行。

????? 功能強大,操作簡單。操作說明和樣本數據分析教程內容詳盡。

????? 軟件的支持和維護服務周到,軟件廠商QIAGEN資金雄厚,軟件的開發維護團隊強大,改進和升級速度快。

版本更新(點擊進入):

CLC Genomics Workbench發布新版本11.0

CLC Genomics Workbench發布新版本10.0


應用案例(點擊進入):

CLCbio案例一:使用來自Illumina與454測序平臺的南非鮑轉錄組數據,評估De novo組裝技術

CLCbio案例二:使用CLC Genomics Workbench對比分析Toxascaris leonina與Toxocara

CLCbio案例三:三種牛基因組對比分析

CLCbio案例四:宏基因組學發展路上的有力幫手 ?

CLCbio案例五:兒童痰液中微生物群落分析 ?


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